La teoría microbiana de la enfermedad propone que muchas enfermedades son causadas por microorganismos. Solía creer que todas las enfermedades se aparecieron sólo espontáneamente, que llevó a algunas técnicas curativas drásticas, pero microorganismos pueden ser combatidos por antibióticos y una buena higiene.
Fue propuesta por Robert Koch que, para poner a prueba su teoría, tomó sangre de un ratón enfermo de carbunco y se lo inyectó a uno sano. Al poco, enfermó de carbunco y murió. Lo repitió veinte veces y ocurrió lo mismo.
Koch repitió sus experimentos con otras enfermedades como la tuberculosis obteniendo los mismos resultados. Confirmó la idea de que cada enfermedad esta producida por un microorganismo determinado, y cada microorganismo genera una enfermedad diferente. 
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